Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAF4O95104 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms