Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM2O94769 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM2O94769 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM2O94769 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM2O94769 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM2O94769 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM2O94769 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM2O94769 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM2O94769 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM2O94769 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM2O94769 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM2O94769 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM2O94769 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM2O94769 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM2O94769 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM2O94769 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM2O94769 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM2O94769 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM2O94769 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM2O94769 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM2O94769 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM2O94769 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM2O94769 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM2O94769 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM2O94769 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM2O94769 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM2O94769 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM2O94769 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM2O94769 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM2O94769 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM2O94769 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM2O94769 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM2O94769 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM2O94769 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM2O94769 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM2O94769 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM2O94769 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM2O94769 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM2O94769 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM2O94769 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM2O94769 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM2O94769 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM2O94769 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM2O94769 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM2O94769 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM2O94769 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM2O94769 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM2O94769 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM2O94769 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM2O94769 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM2O94769 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM2O94769 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM2O94769 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM2O94769 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM2O94769 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM2O94769 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM2O94769 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM2O94769 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM2O94769 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM2O94769 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM2O94769 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM2O94769 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ECM2O94769 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ECM2O94769 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ECM2O94769 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ECM2O94769 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ECM2O94769 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ECM2O94769 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ECM2O94769 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM2O94769 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM2O94769 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM2O94769 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM2O94769 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM2O94769 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM2O94769 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM2O94769 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM2O94769 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM2O94769 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM2O94769 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM2O94769 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM2O94769 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM2O94769 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM2O94769 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM2O94769 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM2O94769 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM2O94769 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM2O94769 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM2O94769 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM2O94769 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM2O94769 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM2O94769 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM2O94769 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM2O94769 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM2O94769 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM2O94769 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM2O94769 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM2O94769 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM2O94769 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM2O94769 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM2O94769 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms