Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.581e-6■■■■■ 152.7
SF3B1O75533 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.81e-6■■■■■ 152.7
SF3B1O75533 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 152.7
SF3B1O75533 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 152.7
SF3B1O75533 ADAMTS3-201ENST00000286657 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.968e-8■■■■■ 152.6
SF3B1O75533 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.238e-8■■■■■ 152.6
SF3B1O75533 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.049e-7■■■■■ 152.6
SF3B1O75533 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 152.4
SF3B1O75533 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 152.4
SF3B1O75533 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 152.4
SF3B1O75533 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 152.4
SF3B1O75533 CD81-214ENST00000530239 425 ntTSL 226.66■■□□□ 1.862e-6■■■■■ 152.4
SF3B1O75533 TNRC6B-208ENST00000489500 564 ntTSL 29.71□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 152.3
SF3B1O75533 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 152.2
SF3B1O75533 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.847e-7■■■■■ 152.2
SF3B1O75533 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.83e-6■■■■■ 152.2
SF3B1O75533 PPIF-203ENST00000472580 761 ntTSL 518.53■□□□□ 0.567e-7■■■■■ 152.2
SF3B1O75533 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.477e-7■■■■■ 152.2
SF3B1O75533 PPIF-202ENST00000448165 821 ntTSL 217.04■□□□□ 0.327e-7■■■■■ 152.2
SF3B1O75533 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.147e-7■■■■■ 152.2
SF3B1O75533 LLGL1-202ENST00000479155 6004 ntTSL 1 (best)14.63□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 152.2
SF3B1O75533 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.094e-6■■■■■ 152.2
SF3B1O75533 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.147e-7■■■■■ 152.2
SF3B1O75533 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.264e-6■■■■■ 152.2
SF3B1O75533 PCSK6-203ENST00000557794 1196 ntTSL 512.15□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 152.2
SF3B1O75533 PCSK6-202ENST00000398185 3723 ntTSL 1 (best)9.68□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 152.2
SF3B1O75533 SETD3-207ENST00000453938 545 ntTSL 46.92□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 152.2
SF3B1O75533 TMEM241-216ENST00000583048 588 ntTSL 414.11□□□□□ -0.152e-8■■■■■ 152.1
SF3B1O75533 HADHA-201ENST00000380649 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 152.1
SF3B1O75533 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 152
SF3B1O75533 OSBPL5-217ENST00000534157 706 ntTSL 411.28□□□□□ -0.65e-6■■■■■ 152
SF3B1O75533 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 151.9
SF3B1O75533 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 151.9
SF3B1O75533 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.115e-6■■■■■ 151.7
SF3B1O75533 NOP53-207ENST00000598681 1358 ntTSL 524.15■■□□□ 1.465e-6■■■■■ 151.7
SF3B1O75533 BAIAP2-227ENST00000576470 593 ntTSL 222.15■■□□□ 1.145e-6■■■■■ 151.7
SF3B1O75533 NOP53-204ENST00000595143 810 ntTSL 522.03■■□□□ 1.125e-6■■■■■ 151.7
SF3B1O75533 BAIAP2-224ENST00000575989 565 ntTSL 421.23■□□□□ 0.995e-6■■■■■ 151.7
SF3B1O75533 NOP53-212ENST00000600410 4185 ntTSL 216.79■□□□□ 0.285e-6■■■■■ 151.7
SF3B1O75533 NOP53-205ENST00000597985 656 ntTSL 316.58■□□□□ 0.245e-6■■■■■ 151.7
SF3B1O75533 BAIAP2-221ENST00000575750 584 ntTSL 416.38■□□□□ 0.215e-6■■■■■ 151.7
SF3B1O75533 BAIAP2-207ENST00000571530 581 ntTSL 414.92□□□□□ -0.025e-6■■■■■ 151.7
SF3B1O75533 BAIAP2-215ENST00000573894 657 ntTSL 313.73□□□□□ -0.215e-6■■■■■ 151.7
SF3B1O75533 MAST2-202ENST00000372008 2528 ntTSL 512.07□□□□□ -0.485e-6■■■■■ 151.7
SF3B1O75533 NOP53-208ENST00000598959 501 ntTSL 511.57□□□□□ -0.565e-6■■■■■ 151.7
SF3B1O75533 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 151.7
SF3B1O75533 TBC1D5-203ENST00000414318 2088 ntTSL 520.46■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 151.6
SF3B1O75533 TBC1D5-209ENST00000429383 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 151.6
SF3B1O75533 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.29e-10■■■■■ 151.6
SF3B1O75533 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 151.5
SF3B1O75533 LRRC20-202ENST00000357631 2906 ntTSL 218.1■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 151.5
SF3B1O75533 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 151.5
SF3B1O75533 LRRC20-207ENST00000446961 663 ntTSL 216.49■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 151.5
SF3B1O75533 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 151.5
SF3B1O75533 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 151.5
SF3B1O75533 PDIA5-202ENST00000467157 2232 ntTSL 213.86□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 151.5
SF3B1O75533 MIGA1-201ENST00000370791 5288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.82e-7■■■■■ 151.5
SF3B1O75533 MIGA1-202ENST00000443751 6409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 151.5
SF3B1O75533 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 151.2
SF3B1O75533 WDR20-216ENST00000558567 586 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.553e-7■■■■■ 151.2
SF3B1O75533 WDR20-212ENST00000557186 631 ntTSL 39.6□□□□□ -0.873e-7■■■■■ 151.2
SF3B1O75533 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.278e-7■■■■■ 151.1
SF3B1O75533 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.178e-7■■■■■ 151.1
SF3B1O75533 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.038e-7■■■■■ 151.1
SF3B1O75533 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 151.1
SF3B1O75533 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.034e-6■■■■■ 151.1
SF3B1O75533 AKT1-204ENST00000544168 1564 ntTSL 218.27■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 151.1
SF3B1O75533 AKT1-218ENST00000557552 8396 ntTSL 517.29■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 151.1
SF3B1O75533 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 151
SF3B1O75533 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 151
SF3B1O75533 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.274e-6■■■■■ 150.9
SF3B1O75533 C7orf50-208ENST00000491163 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 321.81■■□□□ 1.084e-6■■■■■ 150.9
SF3B1O75533 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.964e-6■■■■■ 150.9
SF3B1O75533 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.824e-6■■■■■ 150.9
SF3B1O75533 C7orf50-207ENST00000488073 853 ntTSL 519.84■□□□□ 0.774e-6■■■■■ 150.9
SF3B1O75533 PTK2B-202ENST00000397497 3161 ntTSL 213.2□□□□□ -0.34e-6■■■■■ 150.9
SF3B1O75533 PTK2B-210ENST00000517339 3914 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.774e-6■■■■■ 150.9
SF3B1O75533 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.591e-6■■■■■ 150.8
SF3B1O75533 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 150.8
SF3B1O75533 SUSD3-203ENST00000465709 463 ntTSL 316.77■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 150.8
SF3B1O75533 ADAM8-207ENST00000537099 1579 ntTSL 221.19■□□□□ 0.983e-9■■■■■ 150.8
SF3B1O75533 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.788e-7■■■■■ 150.8
SF3B1O75533 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.028e-7■■■■■ 150.8
SF3B1O75533 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 150.8
SF3B1O75533 EVL-210ENST00000554045 1754 ntTSL 513.53□□□□□ -0.248e-7■■■■■ 150.8
SF3B1O75533 UVRAG-209ENST00000533454 1823 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 150.8
SF3B1O75533 UVRAG-207ENST00000531818 3152 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 150.8
SF3B1O75533 NUP160-211ENST00000532773 593 ntTSL 510.89□□□□□ -0.672e-9■■■■■ 150.8
SF3B1O75533 UVRAG-208ENST00000532130 1831 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 150.8
SF3B1O75533 NUP160-209ENST00000530326 4811 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.34□□□□□ -1.392e-9■■■■■ 150.8
SF3B1O75533 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.259e-7■■■■■ 150.7
SF3B1O75533 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.089e-7■■■■■ 150.7
SF3B1O75533 PRKCA-201ENST00000284384 2718 ntTSL 58.15□□□□□ -1.14e-6■■■■■ 150.6
SF3B1O75533 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.923e-6■■■■■ 150.5
SF3B1O75533 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.693e-6■■■■■ 150.5
SF3B1O75533 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.173e-6■■■■■ 150.5
SF3B1O75533 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.173e-6■■■■■ 150.5
SF3B1O75533 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.873e-6■■■■■ 150.5
SF3B1O75533 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 150.5
SF3B1O75533 PDLIM5-216ENST00000511767 463 ntTSL 517.58■□□□□ 0.43e-6■■■■■ 150.5
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1003.6 ms