Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms