Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GMDSO60547 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GMDSO60547 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GMDSO60547 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GMDSO60547 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GMDSO60547 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GMDSO60547 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GMDSO60547 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GMDSO60547 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GMDSO60547 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GMDSO60547 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GMDSO60547 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GMDSO60547 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GMDSO60547 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GMDSO60547 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GMDSO60547 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GMDSO60547 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GMDSO60547 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GMDSO60547 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GMDSO60547 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GMDSO60547 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GMDSO60547 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GMDSO60547 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GMDSO60547 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GMDSO60547 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GMDSO60547 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GMDSO60547 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GMDSO60547 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GMDSO60547 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GMDSO60547 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GMDSO60547 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GMDSO60547 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GMDSO60547 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GMDSO60547 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GMDSO60547 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GMDSO60547 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GMDSO60547 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GMDSO60547 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GMDSO60547 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GMDSO60547 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GMDSO60547 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GMDSO60547 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GMDSO60547 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GMDSO60547 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GMDSO60547 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GMDSO60547 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GMDSO60547 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GMDSO60547 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GMDSO60547 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GMDSO60547 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GMDSO60547 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GMDSO60547 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GMDSO60547 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GMDSO60547 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GMDSO60547 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms