Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPLO60437 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPLO60437 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPLO60437 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPLO60437 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPLO60437 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPLO60437 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPLO60437 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPLO60437 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPLO60437 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPLO60437 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPLO60437 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PPLO60437 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPLO60437 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PPLO60437 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPLO60437 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPLO60437 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PPLO60437 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPLO60437 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPLO60437 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPLO60437 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPLO60437 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPLO60437 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPLO60437 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPLO60437 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPLO60437 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPLO60437 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPLO60437 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPLO60437 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPLO60437 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPLO60437 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPLO60437 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPLO60437 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPLO60437 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPLO60437 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPLO60437 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPLO60437 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPLO60437 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPLO60437 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPLO60437 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPLO60437 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PPLO60437 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPLO60437 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPLO60437 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPLO60437 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPLO60437 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPLO60437 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPLO60437 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPLO60437 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPLO60437 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPLO60437 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPLO60437 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPLO60437 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPLO60437 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPLO60437 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPLO60437 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPLO60437 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPLO60437 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PPLO60437 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPLO60437 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPLO60437 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PPLO60437 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPLO60437 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPLO60437 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPLO60437 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPLO60437 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPLO60437 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPLO60437 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPLO60437 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPLO60437 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PPLO60437 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPLO60437 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPLO60437 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPLO60437 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPLO60437 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms