Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms