Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms