Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms