Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms