Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms