Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ZNF316A6NFI3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
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