Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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