Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms