Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRRAPQ9Y4A5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms