Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG6Q9Y2V7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG6Q9Y2V7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms