Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRAK1Q9UPV9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms