Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms