Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARP4Q9UKK3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PARP4Q9UKK3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms