Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MLH3Q9UHC1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MLH3Q9UHC1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MLH3Q9UHC1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MLH3Q9UHC1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MLH3Q9UHC1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MLH3Q9UHC1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
MLH3Q9UHC1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MLH3Q9UHC1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MLH3Q9UHC1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MLH3Q9UHC1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MLH3Q9UHC1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MLH3Q9UHC1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MLH3Q9UHC1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MLH3Q9UHC1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MLH3Q9UHC1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MLH3Q9UHC1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MLH3Q9UHC1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MLH3Q9UHC1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MLH3Q9UHC1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MLH3Q9UHC1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MLH3Q9UHC1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MLH3Q9UHC1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms