Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDRG3Q9UGV2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms