Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM8A1Q9UBU6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM8A1Q9UBU6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms