Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNRD1Q9P1U0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms