Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms