Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAK1IP1Q9NWT1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms