Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOMER3Q9NSC5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOMER3Q9NSC5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOMER3Q9NSC5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOMER3Q9NSC5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOMER3Q9NSC5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOMER3Q9NSC5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOMER3Q9NSC5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOMER3Q9NSC5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOMER3Q9NSC5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOMER3Q9NSC5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOMER3Q9NSC5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOMER3Q9NSC5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOMER3Q9NSC5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOMER3Q9NSC5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOMER3Q9NSC5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOMER3Q9NSC5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOMER3Q9NSC5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOMER3Q9NSC5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOMER3Q9NSC5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOMER3Q9NSC5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOMER3Q9NSC5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms