Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP2Q9NS61 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms