Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
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