Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms