Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNRC6CQ9HCJ0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms