Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPAP3Q9H6T3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms