Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX5Q9H2C1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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