Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms