Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXQ1Q9C009 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXQ1Q9C009 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 465.8 ms