Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP2-4Q9BYR9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms