Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms