Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms