Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms