Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms