Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC32Q9BV29 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC32Q9BV29 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC32Q9BV29 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC32Q9BV29 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC32Q9BV29 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC32Q9BV29 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC32Q9BV29 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC32Q9BV29 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC32Q9BV29 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC32Q9BV29 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC32Q9BV29 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC32Q9BV29 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC32Q9BV29 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC32Q9BV29 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC32Q9BV29 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms