Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms