Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms