Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRACR2AQ9BSW2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms