Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms