Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TM2D3Q9BRN9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TM2D3Q9BRN9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TM2D3Q9BRN9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TM2D3Q9BRN9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TM2D3Q9BRN9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TM2D3Q9BRN9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TM2D3Q9BRN9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TM2D3Q9BRN9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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