Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN18Q99952 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms