Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms