Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP1R9BQ96SB3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R9BQ96SB3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms