Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KC1Q96S38 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms