Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF488Q96MN9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms